宏观显微镜可以同时记录大脑各区域的活动，使实验者可以洞悉小鼠在自发行为和认知行为中神经元活动是如何协调的。利用广泛使用的荧光活性指示剂，例如钙或者电压指示剂，可以实现遗传编码，具有高信噪比和提供对特定细胞类型的活动观察。本方案基于转基因小鼠技术与先进的记录技术相结合，使实验者可实现对小鼠整个皮层进行高空间和时间分辨率成像。随着神经活动指示剂的不断升级，新的手术能够通过完整的颅骨获取神经信号，减少潜在的脑外伤、炎症和组织再生，这使得宽场成像非常适合纵向研究和高通量分析。